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Phylogenetic analysis of Berkeleyomyces rouxiae, the primary cause of black root rot in Scabiosa atropurpurea var. Cotton Candy Scoop, and its biological management with Trichoderma spp.

dc.contributorSaenz Aponte, Adriana
dc.contributorRodriguez Bocanegra, Maria Ximena
dc.contributorRestrepo Cardona, Fanny
dc.creatorDiaz Zarate, Valeria Catalina
dc.date2024-01-30T21:42:15Z
dc.date2024-01-30T21:42:15Z
dc.date2023-11-24
dc.date.accessioned2025-10-30T13:09:16Z
dc.date.available2025-10-30T13:09:16Z
dc.identifierhttp://hdl.handle.net/10554/66218
dc.identifierhttps://doi.org/10.60794/b830-2669
dc.identifierinstname:Pontificia Universidad Javeriana
dc.identifierreponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javeriana
dc.identifierrepourl:https://repository.javeriana.edu.co
dc.identifier.urihttp://test.repositoriodigital.com:8080/handle/123456789/176142
dc.descriptionS. atropurpurea var. Cotton Candy Scoop es una planta ornamental de gran importancia económica que ha enfrentado problemas desde 2018 debido a la infección de la pudrición negra de la raíz. Esta enfermedad es causada por Thielaviopsis basicola, el cual ha sido identificado como dos especies fúngicas distintas dentro del género Berkeleyomyces (B. basicola y B. rouxiae). Para confirmar el agente causal de la infección de la pudrición negra de la raíz en S. atropurpurea, se llevó a cabo un análisis filogenético del patógeno. Además, se evaluó el uso de Trichoderma spp. como método de manejo biológico del patógeno, en condiciones de invernadero comercial y se estableció la sintomatología asociada a estas flores. Se llevó a cabo la construcción de un árbol filogenético mediante el método Neighbor-Joining, y diversas especies de la familia Ceratocystidaceae. Con el fin de evaluar la eficacia de Trichoderma spp como control biológico, se llevó a cabo un ensayo usando productos comerciales (Trichotrópico y Triderma+Biohar Forte). Se realizó un muestreo destructivo semanal de 6 plantas por tratamiento hasta la semana 10. Durante este proceso, se registró la longitud de la raíz hasta la semana 10, así como la longitud total de las plantas y las hojas hasta la semana 6. Además, se determinó el porcentaje de severidad para cada planta muestreada. A partir de estas plantas, se estableció una escala de severidad. El árbol de filogenia realizado respaldó la división de T. basicola en dos grupos. Al analizar las plantas expuestas al patógeno, se observó que las plantas tratadas con el producto comercial Trichotrópico tuvieron una longitud total mayor que aquellas tratadas con Triderma+Biohar, y estas diferencias fueron estadísticamente significativas. Por otro lado, las plantas tratadas con Triderma+Biohar Forte mostraron un mayor crecimiento en el sistema radicular en comparación con las tratadas con Trichotrópico y las plantas del grupo control a la décima semana. Sin embargo, no se encontraron diferencias significativas en cuanto al efecto de los tratamientos sobre la severidad de B. rouxiae. Según el análisis filogenético, se puede concluir que B. rouxiae es el causante de la pudrición negra de la raíz en las plantas de S. atropurpurea var. Cotton Candy Scoop. Los estudios realizados no demostraron un efecto significativo en el control del patógeno B. rouxiae. No obstante, el tratamiento que presentó la mayor disminución en el porcentaje de severidad fue la aplicación de Triderma+Biohar Forte. Es esencial utilizar una escala de daño que permita evaluar el impacto real de esta enfermedad en la salud de las plantas.
dc.descriptionDanziger S.A.S
dc.descriptionS. atropurpurea var. Cotton Candy Scoop, a significant ornamental plant in terms of its economic value, has encountered challenges since 2018 as a result of being infected with black root rot. The causative agent of this disease is Thielaviopsis basicola, which has been recognized as two separate fungal species belonging to the genus Berkeleyomyces (B. basicola and B. rouxiae). In order to verify the causal agent responsible for the infection of black root rot in S. atropurpurea, a phylogenetic analysis of the pathogen was performed. Furthermore, the efficacy of utilizing Trichoderma spp. as a biological management approach for controlling the pathogen was investigated under commercial greenhouse conditions, along with the identification of associated symptoms in these flowers. The construction of a phylogenetic tree was accomplished using the Neighbor-Joining method, encompassing diverse species belonging to the Ceratocystidaceae family. To assess the efficacy of Trichoderma spp. as a biological control agent, an experiment was conducted utilizing commercially available products, namely Trichotropico, Triderma and Biohar Forte. Destructive sampling of six plants per treatment was performed on a weekly basis until the tenth week. Throughout this procedure, the length of the roots was measured until week 10, while the total length of the plants and leaves was recorded until week 6. Furthermore, the severity percentage was calculated for each plant that was sampled. A severity scale was established based on these plants. The phylogeny tree analysis confirmed the division of T. basicola into two distinct groups. Upon examining the plants that were exposed to the pathogen, it was noted that the ones treated with the commercial product Trichotropic exhibited a significantly greater total length compared to those treated with Triderma+Biohar. Conversely, the plants treated with Triderma+Biohar Forte displayed enhanced growth in the root system when compared to both Trichotropic-treated plants and the control group at the tenth week. Nevertheless, there were no notable disparities observed in terms of the impact of the treatments on the severity of B. rouxiae. Based on the phylogenetic analysis, it can be inferred that B. rouxiae is the underlying cause of black root rot in S. atropurpurea var plants. The investigations conducted failed to exhibit a significant influence in controlling the pathogen B. rouxiae. However, among the treatments administered, the application of Triderma+Biohar Forte resulted in the most substantial reduction in the severity percentage. It is imperative to employ a damage scale that enables an accurate assessment of the actual consequences of this disease on plant well-being.
dc.descriptionBiólogo (a)
dc.descriptionPregrado
dc.formatPDF
dc.formatapplication/pdf
dc.formatapplication/pdf
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherPontificia Universidad Javeriana
dc.publisherBiología
dc.publisherFacultad de Ciencias
dc.rightsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
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dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectBerkeleyomyces rouxiae
dc.subjectScabiosa atropurpurea
dc.subjectTrichoderma
dc.subjectControl Biológico
dc.subjectEscala de Severidad
dc.subjectFilogenia
dc.subjectBerkeleyomyces rouxiae
dc.subjectScabiosa atropurpurea
dc.subjectTrichoderma
dc.subjectBiologic control
dc.subjectSeverity Scale
dc.subjectPhylogeny
dc.subjectBiología - Tesis y disertaciones académicas
dc.subjectControl biológico
dc.subjectFilogenia
dc.titleAnálisis filogenético de Berkeleyomyces rouxiae, agente causal de la pudrición negra de la raíz en Scabiosa atropurpurea var. Cotton Candy Scoop, y su manejo biológico con Trichoderma spp.
dc.titlePhylogenetic analysis of Berkeleyomyces rouxiae, the primary cause of black root rot in Scabiosa atropurpurea var. Cotton Candy Scoop, and its biological management with Trichoderma spp.
dc.typehttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.typeTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dc.typehttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis


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