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Genetic variability study of field Leptospira spp. isolates in beef and double purpose bovine production systems

Estudio de variabilidad genética en aislamientos de Leptospira spp., en sistemas bovinos de carne y doble propósito;
Estudo de variabilidade genética em isolamentos de Leptospira spp., em sistemas bovinos de carne e duplo propósito

dc.creatorCassalett Bustillo, Elizabeth Regina
dc.creatorPatiño Burbano, Rocío Esperanza
dc.creatorRodríguez-Bautista, José Luis
dc.creatorParra Arango, José Luis
dc.date2016-07-14
dc.date.accessioned2020-08-04T20:35:49Z
dc.date.available2020-08-04T20:35:49Z
dc.identifierhttp://revista.corpoica.org.co/index.php/revista/article/view/492
dc.identifier10.21930/rcta.vol17_num2_art:492
dc.identifier.urihttp://test.repositoriodigital.com:8080/handle/123456789/4612
dc.descriptionLeptospira spp. serovars were isolated from bovine kidney and urine in the Cundinamarca and Meta departments of Colombia. The isolates were classified by both, phylogenetic analysis and ribotyping, using 16SDNAr as a marker gene. The Phylogenetic analysis allowed the classification of the isolates into two of the three genomaspecies recognized: pathogenic and intermediate. The latter is of great importance because its immunological behavior in a host is unknown and this could generate variable answers. Ribotyping yielded “ribopatterns” of four Leptospira isolates and five reference strains with major identity; the analysis showed the presence of two predominant profiles in the four isolates. One profile was in line with the intermediate reference strain and the other profile was similar to the pathogenic reference strain, Copenhageni and Lai serovars. The isolate by phylogenetic analysis was placed within the intermediate type Leptospiras and its pathogenicity is still under study. The phylogenetic analysis of Leptospira species based on comparative sequences of 16SDNAr gene confirmed the possibility of identifying three groups according to their pathogenic status (pathogenic, intermediate and saprophytic), where the taxonomic purpose of the markers, showed consistent results in obtaining sequences of the 16SDNAr gene, grouped in a phylogenetic tree.en-US
dc.descriptionA partir de riñón y orina de bovinos, se aislaron en campo serovares de Leptospira spp., en los departamentos de Cundinamarca y Meta, Colombia. Los aislamientos fueron clasificados mediante análisis filogenético y ribotipificación, utilizando como marcador el gen 16S ADNr. El análisis filogenético permitió clasificar los aislamientos en dos de las tres genomoespecies reconocidas: patógeno e intermedio, siendo este último de gran importancia, dado que no se conoce su patrón de comportamiento inmunológico ante un huésped, lo que podría generar respuestas variables. En la ribotificación se obtuvieron ribopatrones de cuatro aislamientos de leptospira y cinco cepas de referencia con mayor identidad y su análisis mostró la presencia de dos perfiles predominantes dentro de los cuatro aislamientos. Un perfil coincidió con la cepa de referencia intermedia y otro perfil fue similar a la cepa de referencia patógena serovares Copenhageni y Lai. El análisis filogenético del aislamiento, fue agrupado dentro de leptospiras tipo intermedio y su patogenicidad se encuentra todavía en estudio. Los análisis filogenéticos de especies de leptospiras basados en secuencias comparativas del gen 16S ADNr, permiten confirmar e identificar tres grupos según su estatus de patogenicidad (patógeno, saprofítico e intermedio), donde el propósito taxonómico de los marcadores genera resultados consistentes en obtener secuencias del gen 16S ADNr agrupados en un árbol filogenético.es-ES
dc.descriptionA partir de rim e urina de bovinos, se isolaram em campo serovares de Leptospira spp., nos departamentos de Cundinamarca e Meta, Colômbia. Os isolamentos foram classificados mediante análise filogenética e ribotipificação, utilizando como marcador o gene 16S ADNr. A análise filogenética permitiu clasificar os isolamentos em dois das três genomo-espécies reconhecidas: patógeno e intermédio, sendo este último de grande importância, dado que não se conhece o seu padrão de comportamento imunológico perante um hóspede, o que poderia gerar respostas variáveis. Na ribotificação obtiveram-se ribopatrões de quatro isolamentos de leptospira e cinco cepas de referência com maior identidade e a sua análise mostrou a presença de dois perfis predominantes dentro dos quatro isolamentos. Um perfil coincidiu com a cepa de referência intermédia e outro perfil foi similar à cepa de referência patógena serovares Copenhageni e Lai. A análise filogenética do isolamento, foi agrupada dentro de leptospiras tipo intermédio e a sua patogenicidade se encontra ainda em estudo. As análises filogenéticas de espécies de leptospiras baseados em sequências comparativas do gene 16S ADNr, permitem confirmar e identificar três grupos segundo o sue status de patogenicidade (patógeno, saprofítico e intermédio), onde o propósito taxonómico dos marcadores gera resultados consistentes em obter sequências do gene 16S ADNr agrupados em uma árvore filogenética. pt-BR
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherCorporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (Agrosavia)es-ES
dc.relationhttp://revista.corpoica.org.co/index.php/revista/article/view/492/391
dc.sourceCiencia y Tecnología Agropecuaria; Vol. 17 No. 2 (2016); 229-236en-US
dc.sourceCiencia & Tecnología Agropecuaria; Vol. 17 Núm. 2 (2016); 229-236es-ES
dc.sourcerevista Corpoica Ciência e Tecnologia Agropecuária; v. 17 n. 2 (2016); 229-236pt-BR
dc.source2500-5308
dc.source0122-8706
dc.source10.21930/rcta.vol17-num2
dc.subjectGenen-US
dc.subjectRibosomal ADNen-US
dc.subjectLeptospiraen-US
dc.subjectCattleen-US
dc.subjectPhylogenyen-US
dc.subjectgenes-ES
dc.subjectADN Ribosomales-ES
dc.subjectleptospiraes-ES
dc.subjectganado bovinoes-ES
dc.subjectfilogeniaes-ES
dc.titleGenetic variability study of field Leptospira spp. isolates in beef and double purpose bovine production systemsen-US
dc.titleEstudio de variabilidad genética en aislamientos de Leptospira spp., en sistemas bovinos de carne y doble propósitoes-ES
dc.titleEstudo de variabilidade genética em isolamentos de Leptospira spp., em sistemas bovinos de carne e duplo propósitopt-BR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.citationsCerqueira GM, Picardeau M. 2009. A century of Leptospira strain typing. Infect Genet Evol. 9(5)760-768. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2009.06.009 Díaz OL, Orjuela JE, Ortiz J, Patiño A, Linares C, González PM. 2011. Colombia, sanidad animal 2009. Bogotá,Colombia: ICA. Fenner JS, Anjum MF, Randall LP, Pritchard GC, Wu G,Errington J, Dalley CG, Woodward MJ. 2010. Analysisof 16S rDNA sequences from pathogenic Leptospira serovars and use of single nucleotide polymorphisms for rapidspeciation by D-HPLC. Res Vet Sci. 89(1)48-57. https://doi.org/10.1016/j.rvsc.2009.12.014 Grimont F, Grimont PA. 1986. Ribosomal ribonucleic acid gene restriction patterns as potential taxonomic tools.Ann Inst Pasteur Microbiol. 137(2):165-175. https://doi.org/10.1016/S0769-2609(86)80105-3 Janda JM, Abbott SL. 2007. 16S rRNA gene sequencing for bacterial identification in the diagnostic laboratory: pluses,perils, and pitfalls. J Clin Microbiol. 45(9):2761-2764. https://doi.org/10.1128/JCM.01228-07 Matthias MA, Ricaldi JN, Cespedes M, Diaz MM, Galloway RL, Saito M, Steigerwalt AG, Patra KP, Ore CV, Gotuzzo E, et al. 2008. Human leptospirosis caused by a new,antigenically unique Leptospira associated with a Rattus species reservoir in the Peruvian Amazon. PLoS Negl Trop Dis. 2(4)e213. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0000213 Moreno N, Agudelo-Flórez P. 2010. Aplicación de las pruebas de PCR convencional simple y múltiple para la identificación de aislamientos de Leptospira spp. en Colombia. Rev Peru Med Exp Salud Publica. 27(4):548-556. https://doi.org/10.1590/S1726-46342010000400009 Morey RE, Galloway RL, Bragg AL, Steigerwalt AG, Levett PN.2006. Species-specific identification of Leptospiraceae by 16S rRNA gene sequencing. J Clin Microbiol. 44(10):3510-3516.https://doi.org/10.1128/JCM.00670-06 Organización Mundial de Sanidad Animal. 2008. Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008. Paris, Francia: OIE.Capítulo 2.1.9. Leptospirosis; pp. 251-260. Paster BJ, Dewhirst FE, Weisburg WG, Tordoff LA, Fraser GJ, Hespell RB, Stanton TB, Zablen L, Mandelco L, Woese CR. 1991. Phylogenetic analysis of the spirochetes. J Bacteriol. 173(19):6101-6109. https://doi.org/10.1128/JB.173.19.6101-6109.1991 Postic D, Riquelme-Sertour N, Merien F, Perolat P, Baranton G. 2000. Interest of partial 16S rDNA gene sequences to resolve heterogeneities between Leptospira collections:application to L. meyeri. Res Microbiol. 151(5):333-341. https://doi.org/10.1016/S0923-2508(00)00156-X Romero-Vivas CM, Thiry D, Rodríguez V, Calderón A,Arrieta G, Mattar S, Cuello M, Levett P, Falconar AK.2013. Serovar characterization at the molecular level of Leptospira spp. isolates from animals and water in Colombia.Biomédica. 33(Supl. 1):179-184. https://doi.org/10.7705/biomedica.v33i0.731 Schmid GP, Steere AC, Kornblatt AN, Kaufmann AF, Moss CW, Johnson RC, Hovind-Hougen K, Brenner DJ. 1986.Newly recognized Leptospira species ("Leptospira inadai"serovar lyme) isolated from human skin. J Clin Microbiol.24(3):484-486. https://doi.org/10.1128/JCM.24.3.484-486.1986 Torres L, Rodríguez JL, Jiménez SC, Patiño RE. 2013.Genotipificación de aislamientos Colombianos de Leptospira.Resumen presentado en: II Congreso Brasileiro de Recursos Genéticos. Belem, Brasil. Zuluaga AG. 2009. Factores de riesgo asociados a leptospirosis en hatos bovinos de Pereira, 2002-2005. Investig Andina. 11(19):109-117.0


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