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Parámetros epidemiológicos para el modelamiento matemático del brote multipaís de mpox 2022-2023 : estimaciones globales, de América Latina y Colombia

Epidemiological parameters for mathematical modelling of the multi-country outbreak of mpox 2022-2023 : global, Latin American and Colombian estimates

dc.contributorCucunubá Pérez, Zulma Milena
dc.contributorBuitrago López, Danuby Adriana
dc.contributorCortes Luna, Jorge Alberto
dc.contributorQuevedo Vega, David Santiago
dc.contributorAlvarez, Carlos
dc.contributorGil Laverde, Jacky Fabian Armando
dc.creatorDiaz Brochero, Candida
dc.date2025-02-20T21:08:56Z
dc.date2025-02-20T21:08:56Z
dc.date2024-10-21
dc.date.accessioned2025-04-22T22:11:42Z
dc.date.available2025-04-22T22:11:42Z
dc.identifierhttp://hdl.handle.net/10554/69614
dc.identifierinstname:Pontificia Universidad Javeriana
dc.identifierreponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javeriana
dc.identifierrepourl:https://repository.javeriana.edu.co
dc.identifier.urihttp://test.repositoriodigital.com:8080/handle/123456789/90629
dc.descriptionAntecedentes: El brote de mpox de 2022-2023 ha sido el más grande de la historia. Existe un vacío de conocimiento en cuanto a los parámetros de transmisión y gravedad para el modelamiento matemático del impacto de esta epidemia especialmente en Latinoamérica. Objetivos: 1) Sintetizar parámetros epidemiológicos relacionados con la transmisión y severidad del brote de mpox 2022-23; 2) Estimar el número efectivo de reproducción, R(t) en Argentina, Brasil, Chile, Colombia, México y Perú; y 3) Ajustar distribuciones de probabilidad posteriores del número de parejas sexuales en la comunidad LGTBIQ+ en Colombia. Métodos: 1) Revisión sistemática de estudios observacionales en MEDLINE, EMBASE y otras fuentes hasta septiembre de 2023. Evaluación de calidad utilizando la apreciación crítica del JBI para series de casos, estudios transversales y de cohortes, y una evaluación de calidad diseñada para modelos matemáticos. El metanálisis se realizó mediante un modelo de efectos aleatorios. 2) A partir de los datos de vigilancia de la OPS, se examinaron las curvas epidémicas y se calculó el número de reproducción efectivo, R(t), para cada país. 3) Con base en los datos de una encuesta en línea (CoSex) que incluyó adultos de las comunidades LGTBIQ+ en Colombia de mayo a agosto de 2023, ajustamos distribuciones posteriores del número de parejas sexuales según variables sociodemográficas y de comportamiento sexual. Ajustamos dos tipos de distribuciones: binomial negativa (incluyendo individuos con cero conteo de parejas) y Weibull (incluyendo únicamente datos de individuos con conteo de parejas diferente a cero). Resultados: 1) Se estimó un periodo de incubación de 7.60 (IC 95%: 7.14-8.10) días, un intervalo serial de 8.30 (IC 95%: 6.74-10.23) días. Un estudio estimó un tiempo generacional de 12.5 días (IC 95%: 7.5-17.3). El R(t) varió entre 1.16 y 3.74 y el número básico de reproducción (R0) entre 0.006 y 7.84 para redes poco y muy interconectadas, respectivamente. Estimamos una probabilidad de muerte en los casos (CFR) agrupado por continente: 0.19% (IC 95%: 0.09-0.37) para América y 0.33% (IC 95%: 0.15-0.7) para Europa. En el caso de África, se observó que los CFR de los países asociados al clado I eran más elevados (rango 17-64%) que los asociados al clado IIb (rango 0-6%). 2) El R(t) varió ligeramente entre los países latinoamericanos: Argentina (2.63; 0.85 a 5.39), Brasil (3.13; 2.61 a 3.69), Chile (2.91; 1.55 a 4.70), Colombia (3.15; 2,07 a 4,44), México (2.28; 1,18 a 3.75) y Perú (2.84; 2.33 a 3.40). La epidemia alcanzó su punto máximo entre agosto y septiembre de 2022, posteriormente, los valores de R(t) cayeron por debajo de 1. 3) Se analizó a un total de 784 individuos para estimar el número y la distribución de parejas sexuales. El rango fue de 0-400 en el último año, y de 0-45 en el último mes, con medias ajustadas más altas para los hombres (9.07; ICr del 95%: 8.29-9.92), edades de 30-41 años (10.4; ICr del 95%: 8.92-12.06), orientación bisexual (9.54; ICr 95%: 7.89-11.55), relaciones sexuales en grupo (17.35; ICr 95%: 14.83-20.26), relaciones sexuales transaccionales (16.48; ICr 95%: 13.11-20.51) y uso de profilaxis pre-exposición para VIH (21.3; ICr 95%: 15.99-27.99). Conclusiones: El intervalo serial fue ligeramente mayor que el periodo de incubación, lo que sugiere que la transmisión se produce sobre todo tras la aparición de los síntomas. La gravedad fue mayor en los países africanos vinculados al clado I y menor en los americanos, vinculados al clado II. En América Latina, el R(t) máximo varió entre 2,6 y 3,7, y posteriormente cayó por debajo de 1 a pesar de la ausencia de programas de vacunación. La media ajustada de parejas sexuales en la comunidad LGTBIQ+ encuestada varió entre 4 y 21 en función del sexo y los comportamientos sexuales siguiendo una distribución altamente sobredispersa (Binomial Negativa o Weibull). Estos parámetros en conjunto apoyan la explicación de una primera epidemia de mpox grande y de baja severidad clínica en América Latina y Colombia concentrada en redes sexuales altamente interconectadas particularmente entre hombres. Se necesitarán más trabajos de modelamiento matemático para estimar el riesgo de reemergencia más allá de estas redes y para otros clados.
dc.descriptionNinguno
dc.descriptionBackground: The 2022-2023 mpox outbreak has been the largest in history. There is a knowledge gap in terms of transmission and severity parameters for mathematical modeling of the impact of this epidemic especially in Latin America. Objectives: 1) To synthesize epidemiological parameters related to the transmission and severity of the mpox 2022-23 outbreak; 2) To estimate the effective reproduction number R(t) in Argentina, Brazil, Chile, Colombia, Mexico and Peru; and 3) To fit posterior probability distributions of the number of sexual partners in the LGTBIQ+ community in Colombia. Methods: 1) Systematic review of observational studies in MEDLINE, EMBASE and other sources up to September 2023. Quality assessment using the JBI critical appraisal for case series, cross-sectional, and cohort studies, and a designed quality assessment for mathematical models. Meta-analysis was performed using a random-effects model. 2) Using PAHO surveillance data, we examined epidemic curves, and calculated the effective reproduction number, R(t) for each country. 3) Based on the data from an online survey (CoSex) that included adults from the LGTBIQ+ communities in Colombia from May to August 2023, we fitted posterior distributions of the number of sexual partners according to socio-demographic and sexual behavior variables. We adjusted two types of distributions: negative binomial (for zero-count partners) and Weibull (for non-zero count partners). Results: 1) We estimated a pooled incubation period of 7.60 (95% CI: 7.14-8.10) days, a pooled serial interval of 8.30 (95% CI: 6.74-10.23) days. One study reported a generation time of 12.5 days (95% CI 7.5-17.3). R(t) varied between 1.16 to 3.74 and reproduction number (R0) between 0.006 and 7.84 for low and highly interconnected networks respectively. We estimated a pooled case fatality rate (CFR) by continent: 0.19% (95% CI 0.09-0.37) for the Americas and 0.33% (95% CI 0.15-0.7) for Europe. For Africa, we found CFRs of countries associated with Clade I were higher (range 17-64%) than those associated with Clade IIb (range 0-6%). 2) R(t) varied slightly across Latin American countries: Argentina (2.63; 0.85 to 5.39), Brazil (3.13; 2.61 to 3.69), Chile (2.91; 1.55 to 4.70), Colombia (3.15; 2.07 to 4.44), Mexico (2.28; 1.18 to 3.75), and Peru (2.84; 2.33 to 3.40). The epidemic peaked between August-September 2022 with R(t) values dropping below 1 afterwards. 3) A total of 784 individuals were analyzed to estimate the number and distribution of sexual partners. The range was 0-400 in the past year, and 0-45 in the past month, with fitted means higher for men (9.07, 95% CIr 8.29-9.92), ages 30-41 years (10.4; 95% CrI 8.92-12.06), bisexual orientation (9.54, 95% CrI 7.89-11.55), reporting group sex (17.35, 95% CrI 14.83-20.26), transactional sex (16.48, 95% CIr 13.11-20.51), and using pre-exposure prophylaxis for HIV (21.3, 95% CIr 15.99-27.99). Conclusions: Serial interval was slightly larger than incubation period, suggesting transmission occurs mostly post-symptom onset. Severity was higher in African countries linked to Clade I and lower in the Americas, linked to Clade II. In Latin America, the maximum R(t) varied between 2.6 and 3.7, and dropped below 1 despite absence of vaccination programs. The fitted average number of sexual partners in LGTBIQ+ surveyed community varied between 4 and 21 depending on sex and sexual behaviors, following higly overdispersed distributions (Negative Binomial or Weillbull). These parameters together support the explanation of a first large and low clinical severity mpox epidemic in Latin America and Colombia concentrated in highly interconnected sexual networks particularly among men. Further modeling work will be needed to estimate the risk of re-emergence beyond these networks and for other clades.
dc.descriptionMagíster en Epidemiología Clínica
dc.descriptionMaestría
dc.descriptionhttps://orcid.org/my-orcid?orcid=0000-0002-2176-7388
dc.descriptionhttps://scholar.google.com/citations?user=UYpcC44AAAAJ&hl=es
dc.descriptionhttps://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0001856043
dc.formatPDF
dc.formatapplication/pdf
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherPontificia Universidad Javeriana
dc.publisherMaestría en Epidemiología Clínica
dc.publisherFacultad de Medicina
dc.rightsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightsDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, "Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores", los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectMpox
dc.subjectSalud pública
dc.subjectSalud global
dc.subjectEpidemiología
dc.subjectRevisión sistemática
dc.subjectNúmero de reproducción efectivo
dc.subjectParejas sexuales
dc.subjectComportamiento sexual
dc.subjectMpox
dc.subjectPublic health
dc.subjectGlobal health
dc.subjectEpidemiology
dc.subjectSystematic review
dc.subjectEffective reproductive number
dc.subjectSexual partners
dc.subjectSexual behaviour
dc.subjectMaestría en epidemiología clínica - Tesis y disertaciones académicas
dc.subjectMonkeypox virus - América Latina - 2022-2023
dc.subjectMonkeypox virus - Colombia - 2022-2023
dc.subjectParejas sexuales - América Latina - 2022-2023
dc.subjectTransmisión de enfermedades - América Latina - 2022-2023
dc.titleParámetros epidemiológicos para el modelamiento matemático del brote multipaís de mpox 2022-2023 : estimaciones globales, de América Latina y Colombia
dc.titleEpidemiological parameters for mathematical modelling of the multi-country outbreak of mpox 2022-2023 : global, Latin American and Colombian estimates
dc.typehttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.typeTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestría
dc.typehttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.coverageAmérica Latina
dc.coverageColombia
dc.coverage2022-2023


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