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Long non-coding RNAs identification in tissue and liquid biopsy of non-small cell lung cancer patients

dc.contributorRojas Moreno, Adriana Patricia
dc.contributorAyala Ramírez, Paola Andrea
dc.contributorBarreto Prieto, Alfonso
dc.contributorAristizabal Pachon, Andres Felipe
dc.contributorRussi Noguera, July Andrea
dc.creatorBermudez Liscano, Litzy Gisella
dc.date2022-04-01T13:56:18Z
dc.date2022-04-01T13:56:18Z
dc.date2022-03-09
dc.date.accessioned2025-04-22T22:13:58Z
dc.date.available2025-04-22T22:13:58Z
dc.identifierhttp://hdl.handle.net/10554/59415
dc.identifierhttps://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.59415
dc.identifierinstname:Pontificia Universidad Javeriana
dc.identifierreponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javeriana
dc.identifierrepourl:https://repository.javeriana.edu.co
dc.identifier.urihttp://test.repositoriodigital.com:8080/handle/123456789/91232
dc.descriptionEl cáncer de pulmón es la principal causa de muerte por cáncer en el mundo, esta alta tasa de mortalidad se asocia con las dificultades de detección diagnóstica y los altos índices de detección en etapas avanzadas cuando las opciones de tratamiento son limitadas. La búsqueda de biomarcadores derivados del tumor identificables en muestras mínimamente invasivas que acompañan y favorecen la detección oportuna de esta patología ha aumentado en los últimos años. Específicamente, en biopsia líquida se han identificado componentes como células tumorales circulantes, proteínas, ADN y ARNs no codificantes tanto libres como contenido en vesículas extracelulares. El objetivo de este estudio fue evaluar los perfiles de expresión de los ARN largos no codificantes (lncRNA, por sus siglas en inglés) MALAT1, NEAT1, HOTAIR, GAPLINC y H19, en tejido y biopsia líquida de pacientes con diagnóstico de cáncer de pulmón de célula no pequeña (NSCLC, por sus siglas en inglés). Para esto, se analizó la expresión mediante PCR en tiempo real de tres grupos de muestras biológicas: cultivo de líneas celulares de adenocarcinoma de pulmón, cultivo primario de biopsia pulmonar y biopsia líquida de pacientes con cáncer de pulmón NSCLC. Este análisis de expresión se realizó a nivel intracelular (líneas celulares y cultivo primario), extracelular (sobrenadante de cultivo y suero de pacientes) y en vesículas extracelulares (derivadas de cultivo celular y derivadas de suero de pacientes). Los resultados del presente estudio identificaron a GAPLINC como un posible biomarcador diagnóstico detectable en biopsia líquida y cultivo primario de biopsia pulmonar derivado de pacientes con cáncer de pulmón pertenecientes a la población colombiana. Adicionalmente, los lncRNA MALAT1, H19 y NEAT1 aumentaron en cultivo primario de biopsia pulmonar derivada de pacientes con cáncer de pulmón. Sin embargo, en biopsia líquida, aún es necesario la realización de más estudios para su posible validación como biomarcador diagnóstico y pronóstico. Estos hallazgos permitirán ampliar el conocimiento e identificación de potenciales biomarcadores en cáncer de pulmón, contribuyendo al diagnóstico y tratamiento oportuno de esta patología a largo plazo.
dc.descriptionPontificia Universidad Javeriana - Hospital Universitario San Ignacio
dc.descriptionDiagnostic detection difficulties and high detection rates in advanced stages when treatment options are limited. The search for identifiable tumor-derived biomarkers in minimally invasive samples that accompany and favor the timely detection of this pathology has increased in recent years. Specifically, components such as circulating tumor cells, proteins, DNA, and non-coding RNAs, both free and contained in extracellular vesicles, have been identified in liquid biopsy. The objective of this study was to evaluate the expression profiles of the long non-coding RNAs (lncRNAs) MALAT1, NEAT1, HOTAIR, GAPLINC, and H19, in tissue and liquid biopsy of patients diagnosed with lung cancer. non-small cell (NSCLC). Thus, the expression was analyzed by real-time PCR of three groups of biological samples: culture of lung adenocarcinoma cell lines, primary culture of lung biopsy, and liquid biopsy of patients with NSCLC lung cancer. This expression analysis was performed at the intracellular (cell lines and primary culture), extracellular (culture supernatant and patient serum), and extracellular vesicles (cell culture-derived and patient serum-derived) levels. The results of the present study identified GAPLINC as a possible diagnostic biomarker detectable in liquid biopsy and primary culture of lung biopsy derived from lung cancer patients belonging to the Colombian population. Additionally, the lncRNAs MALAT1, H19, and NEAT1 were increased in primary culture of lung biopsy derived from patients with lung cancer. However, in liquid biopsy, more studies are still needed for its possible validation as a diagnostic and prognostic biomarker. These findings will allow expanding the knowledge and identification of potential biomarkers in lung cancer, contributing to the timely diagnosis and treatment of this pathology in the long term.
dc.descriptionMagíster en Ciencias Biológicas
dc.descriptionMaestría
dc.description0000-0002-6563-7067
dc.descriptionhttps://scholar.google.com/citations?user=9DGkicIAAAAJ&hl=es
dc.descriptionhttps://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000128487
dc.formatPDF
dc.formatapplication/pdf
dc.formatapplication/pdf
dc.formatapplication/pdf
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherPontificia Universidad Javeriana
dc.publisherMaestría en Ciencias Biológicas
dc.publisherFacultad de Ciencias
dc.rightsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccess
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dc.rightshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.subjectBiomarcador
dc.subjectlncRNA
dc.subjectBiopsia líquida
dc.subjectEpigenética
dc.subjectCáncer de pulmón
dc.subjectBiomarker
dc.subjectlncRNA
dc.subjectLiquid biopsy
dc.subjectEpigenetics
dc.subjectLung cancer
dc.subjectMaestría en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
dc.subjectEpigenética
dc.subjectMarcadores bioquímicos
dc.subjectNeoplasias pulmonares
dc.titleIdentificación de ARN largos no codificantes en tejido y biopsia líquida de pacientes con diagnóstico de cáncer de pulmón NSCLC
dc.titleLong non-coding RNAs identification in tissue and liquid biopsy of non-small cell lung cancer patients
dc.typehttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.typeTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestría
dc.typehttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.coverageColombia
dc.coverage2021-2022
dc.coverageCundinamarca (Colombia)
dc.coverageBogotá, D.C. (Bogotá, Colombia)
dc.coverageBogotá (Colombia)


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